L'une des expériences les plus puissantes d'Amsterdam est la visite de la Anne Frank Huis, qui sert à personnaliser intimement les effets catastrophiques de l'Holocauste. En 1933, Anne Frank, sa sœur Margot et leurs parents, Otto et Edith, ont fui l'Allemagne et se sont installés à Amsterdam, où Otto a fondé des entreprises. Lors de l'invasion des Pays-Bas par l'Allemagne en 1940, la famille et deux de leurs collègues ont cherché refuge dans l'"Annexe secrète" des locaux de travail d'Otto, où ils ont été malheureusement trahis deux ans plus tard. Pendant ce temps, Anne tient un journal que son père, seul survivant, publie et immortalise son histoire et sa vie.

Le musée contient des médias interactifs, tels que des films d'actualités de la Seconde Guerre mondiale recouvrant le journal d'Anne, les bureaux du partenaire commercial d'Otto Frank, des effets personnels et des documents, et des modèles de l'annexe non meublée qui illustrent les conditions de vie exiguës. Les téléspectateurs peuvent également jeter un coup d'œil dans la chambre d'Anne, décorée de photos de stars hollywoodiennes et de membres de la famille royale néerlandaise et comprendre les mesures que les cacheurs ont dû prendre pour éviter d'être détectés. Après avoir exploré l'annexe, les visiteurs peuvent visionner plus de vidéos dans la maison avant, ainsi que le journal d'Anne affiché dans une vitrine.